法定報告傳染病隨著新的傳染性疾病的出現和流行，甲、乙類法定報告傳染病病種有所調整。
1989年及以前法定報告傳染病包括鼠疫、霍亂及副霍亂、天花、白喉、流腦、百日咳、猩紅熱、麻疹、流感、痢疾、傷寒副傷寒、斑疹傷寒、回歸熱、布氏桿菌病、炭疽病、病毒性肝炎、脊髓灰質炎、乙腦、狂犬病、瘧疾、黑熱病、森林腦炎、恙蟲病、出血熱和鉤端螺旋體病等25種。
根據1989年頒布的《中華人民共和國傳染病防治法》，1990一1995年甲、乙類法定報告傳染病包括鼠疫、霍亂、病毒性肝炎、痢疾、傷寒和副傷寒、艾滋病、淋病、梅毒、脊髓灰質炎、麻疹、百日咳、白喉、流腦、猩紅熱、流行性出血熱、狂犬病、鉤端螺旋體病、布魯菌病、炭疽、流行性和地方性斑疹傷寒、流行性乙型腦炎、黑熱病、瘧疾、登革熱25種。
2002年增加HIV感染者。添加新
2003年增加傳染性非典型肺炎。
2008年5月2日，衛生部將手足口病列入國家傳染病防治法規定的丙類傳染病進行管理。
2009年4月30日，衛生部將甲型H1N1流感納入國家傳染病防治法規定的乙類傳染病，并采取甲類傳染病的預防、控制措施。
目前法定傳染病共計39種，其中甲類傳染病2種，乙類傳染病26種，丙類傳染病11種。
甲類傳染病甲類傳染病也稱為強制管理傳染病，包括：鼠疫、霍亂，共2種。對此類傳染病發生后報告疫情的時限，對病人、病原攜帶者的隔離、治療方式以及對疫點、疫區的處理等，均強制執行。
乙類傳染病乙類傳染病也稱為嚴格管理傳染病，共26種包括：傳染性非典型肺炎、甲型H1N1流感[1]、艾滋病、病毒性肝炎、脊髓灰質炎、人感染高致病性禽流感、麻疹、流行性出血熱、狂犬病、流行性乙型腦炎、登革熱、炭疽、細菌性和阿米巴性痢疾、肺結核、傷寒和副傷寒、流行性腦脊髓膜炎、百日咳、白喉、新生兒破傷風、猩紅熱、布魯氏菌病、淋病、梅毒、鉤端螺旋體病、血吸蟲病、瘧疾、甲型H1N1流感（原稱人感染豬流感），共26種。對此類傳染病要嚴格按照有關規定和防治方案進行預防和控制。其中，傳染性非典型肺炎、炭疽中的肺炭疽、人感染高致病性禽流感和甲型H1N1流感這四種傳染病雖被納入乙類，但可直接采取甲類傳染病的預防、控制措施。[2]
丙類傳染病
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