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    為什么癌癥基因檢測(cè)不是“萬(wàn)能”的?答案就在這里

     binho900 2016-09-08
    干貨 | 靠譜 | 實(shí)用  

    《轉(zhuǎn)》譯

    《轉(zhuǎn)》譯是轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)網(wǎng)原創(chuàng)編譯類(lèi)品牌欄目, 重點(diǎn)關(guān)注基因檢測(cè)、細(xì)胞治療、體外診斷、精準(zhǔn)醫(yī)療等轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,旨在傳遞國(guó)外新技術(shù)、新動(dòng)態(tài),同時(shí)圍繞這些領(lǐng)域的知名企業(yè)、專(zhuān)家觀點(diǎn)、商業(yè)模式等也是《轉(zhuǎn)》譯關(guān)注的重點(diǎn)。


    1995年,科學(xué)家成功克隆乳腺癌易感基因BRCA1和卵巢癌易感基因BRCA2,并將癌癥基因檢測(cè)手段首次應(yīng)用于臨床,預(yù)示著遺傳學(xué)將在治療決策上發(fā)揮重要的作用。攜帶任一BRCA1或BRCA2突變的女性(同時(shí)有乳腺癌或卵巢癌家族史)患乳腺癌或卵巢癌的風(fēng)險(xiǎn)遠(yuǎn)高于一般人群。而現(xiàn)在,這些女性中有人選擇提前切除自己的乳腺和卵巢,避免惡性腫瘤發(fā)生。


    在過(guò)去的幾十年里,科學(xué)家們逐漸意識(shí)到,大部分腫瘤是由基因的異常引起的。遺傳學(xué)分析已成為很多惡性腫瘤(如乳腺癌、肺癌、結(jié)腸癌等)的常規(guī)診斷流程,因?yàn)檫@些信息可能為治療提供指導(dǎo)。科學(xué)家們也開(kāi)發(fā)了不少針對(duì)一些常見(jiàn)突變的藥物。

    但仍有很多癌癥相關(guān)突變,目前并沒(méi)有針對(duì)性的藥物治療。事實(shí)上,這些突變?cè)诎┌Y發(fā)生過(guò)程中起到的具體作用尚不清楚。雖然不同類(lèi)型的癌癥DNA檢測(cè)揭示了大量可能相關(guān)的基因突變,但真正能為醫(yī)生的治療決策提供指導(dǎo)的信息卻是少之又少。目前,美國(guó)FDA只批準(zhǔn)了29項(xiàng)針對(duì)特定突變的基因檢測(cè),這些檢測(cè)的結(jié)果可以對(duì)治療決策產(chǎn)生直接的影響。

    幾個(gè)大型研究機(jī)構(gòu)正致力于發(fā)現(xiàn)更多可以作為藥物靶點(diǎn)的基因突變。奧巴馬總統(tǒng)也于今年宣布啟動(dòng)“國(guó)家癌癥登月計(jì)劃”(NationalCancerMoonshot),投入10億美元用于推動(dòng)這類(lèi)靶向藥物的研究。但要實(shí)現(xiàn)這一宏大的目標(biāo),仍有很長(zhǎng)的一段路要走。“我們正處在一個(gè)轉(zhuǎn)型期。”國(guó)家癌癥研究所(NationalCancerInstitute,NCI)癌癥流行病學(xué)和遺傳學(xué)部門(mén)主管StephenChanock評(píng)價(jià)道。

    驅(qū)動(dòng)突變vs乘客突變

    能引發(fā)癌癥的基因變異可分為兩大類(lèi)。一種是生殖系突變,是病人從父母那里遺傳而來(lái)的。另一種是體細(xì)胞突變,是由于衰老、吸煙和其他環(huán)境因素的作用,病人自發(fā)產(chǎn)生的基因變異。遺傳性DNA變異通常會(huì)引起侵襲性極強(qiáng)的腫瘤,包括一些兒童期癌癥,不過(guò)這些生殖系突變相對(duì)來(lái)說(shuō)比較少見(jiàn)。大部分癌癥起源于體細(xì)胞突變。

    大部分體細(xì)胞突變是無(wú)害的,很多突變甚至可以被機(jī)體自身的質(zhì)量控制體系修復(fù)。但某些體細(xì)胞突變卻是害群之馬,使細(xì)胞開(kāi)始不受控制地分裂。有害的突變通常會(huì)產(chǎn)生變異的蛋白,這些蛋白或是可以促進(jìn)DNA的大量復(fù)制,或是失去了原本可以阻止細(xì)胞分裂的功能。

    研究者們把那些對(duì)腫瘤的生長(zhǎng)和生存有重要作用的基因突變稱(chēng)作“驅(qū)動(dòng)突變”(driver mutation),而那些看起來(lái)并不重要的基因突變稱(chēng)為“乘客突變”(passenger mutation),這些突變好像只是搭了一段順風(fēng)車(chē)。每種類(lèi)型的癌癥分別需要多少個(gè)驅(qū)動(dòng)突變尚不清楚。一項(xiàng)研究顯示,驅(qū)動(dòng)突變的數(shù)量少則2個(gè),多則8個(gè),而另一些研究則發(fā)現(xiàn),癌癥的發(fā)生通常需要多達(dá)20個(gè)驅(qū)動(dòng)突變。

     初期成果

    盡管要識(shí)別特定腫瘤中哪些基因突變起到重要的作用十分困難,上個(gè)世紀(jì)90年代研究者們?cè)诎邢蛑委煼矫孢€是取得了一些突破性的進(jìn)展。早期的進(jìn)展包括甲磺酸伊馬替尼(商品名是格列衛(wèi)),針對(duì)慢性粒細(xì)胞性白血病的一個(gè)常見(jiàn)驅(qū)動(dòng)突變,和曲妥單抗(商品名是赫賽汀),可治療HER2突變的乳腺癌患者。其他靶向治療的藥物也隨之應(yīng)運(yùn)而生。

    過(guò)去的3年里,肺癌患者常規(guī)篩查ALK基因的突變。其中7%的病人由于遺傳變異,ALK基因和另一個(gè)基因發(fā)生融合,產(chǎn)生變異的蛋白,從而驅(qū)動(dòng)腫瘤的發(fā)生。靶向阻斷這一異常蛋白的藥物能有效減緩疾病進(jìn)展,療效明顯優(yōu)于傳統(tǒng)化療。但ALK基因正常的病人服用抗ALK藥物沒(méi)有任何獲益。

    常規(guī)基因檢測(cè)也是黑色素瘤病人的福音。將近一半的病人攜帶BRAF基因的突變,這一突變可促進(jìn)腫瘤的擴(kuò)散。發(fā)生轉(zhuǎn)移的黑色素瘤病人通常只能存活5.3個(gè)月。2011年,F(xiàn)DA批準(zhǔn)了第一個(gè)針對(duì)BRAF變異蛋白的藥物。近期一項(xiàng)研究顯示,將近80個(gè)黑色素瘤轉(zhuǎn)移的病人對(duì)靶向藥物反應(yīng)良好,平均存活期延長(zhǎng)到2年。

    有時(shí)候,發(fā)現(xiàn)某一特定的突變,可以使醫(yī)生避免使用某些藥物。因?yàn)檫@些基因突變可以使特定藥物失效。比如結(jié)腸癌患者若存在KRAS或者NRAS基因突變,就會(huì)對(duì)某些藥物沒(méi)有反應(yīng)。

    盡管目前已經(jīng)取得了一些進(jìn)展,未來(lái)仍有很多困難有待克服。發(fā)現(xiàn)癌癥中的遺傳變異還不夠,必須要找到那些對(duì)癌癥的生長(zhǎng)和生存至關(guān)重要的變異。我們還需要研發(fā)用于篩查突變的可靠檢測(cè)手段以及針對(duì)這一突變的治療方案。要做到這些并不容易。此外,除了找到那些驅(qū)動(dòng)突變,研究者們還需要知道在驅(qū)動(dòng)之后,還有哪些突變參與了后續(xù)的過(guò)程。在腫瘤生長(zhǎng)的過(guò)程中,可能會(huì)出現(xiàn)新的突變。每一輪突變,都要重新區(qū)分驅(qū)動(dòng)變異和乘客變異。當(dāng)一種藥物失效,醫(yī)生可以根據(jù)后續(xù)的基因檢測(cè)結(jié)果,選擇新的靶向藥物。

    要研發(fā)阻斷驅(qū)動(dòng)突變的藥物也絕非易事。有些變異蛋白就在癌癥細(xì)胞的表面,藥物很容易到達(dá)。但有些變異蛋白則處在細(xì)胞的深處,而能夠進(jìn)入細(xì)胞的藥物通常很小,不足以粘附在它們的靶向蛋白上。這使得很多常見(jiàn)的驅(qū)動(dòng)基因,如p53、RAS和MYC,至今沒(méi)有有效的靶向藥物。

    而那些能成功阻斷體細(xì)胞突變的靶向藥物通常只能延長(zhǎng)較短的生存時(shí)間。針對(duì)某一特定驅(qū)動(dòng)變異的藥物可以使腫瘤縮小,但那些對(duì)藥物抵抗的細(xì)胞可以繼續(xù)增生,產(chǎn)生新的腫瘤。而原來(lái)的藥物對(duì)這一新腫瘤束手無(wú)策。因此,某些癌癥,像HIV一樣,需要多種藥物聯(lián)合治療。不過(guò),每增加一種藥物,就會(huì)增加相應(yīng)的費(fèi)用和潛在的副作用。研究者們需要找到最佳的治療方案。

    很多體細(xì)胞突變十分罕見(jiàn),也阻礙了實(shí)驗(yàn)室成果向臨床應(yīng)用轉(zhuǎn)化。某些突變只存在于不到1%的某癌癥患者中。如果要評(píng)估某個(gè)藥物是否可以靶向治療這些突變的患者,必須進(jìn)行臨床試驗(yàn),但要想找到足夠數(shù)量的病人愿意并且能夠參與試驗(yàn),需要很長(zhǎng)的時(shí)間。

    新方向

    這些挑戰(zhàn)促進(jìn)了研究方法、藥物設(shè)計(jì)、基礎(chǔ)設(shè)施的改進(jìn),以加快精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的進(jìn)步。這些方法也融合了觀念的更新。以前,癌癥是由首次出現(xiàn)的部位來(lái)定義的,如首先出現(xiàn)在乳房的叫乳腺癌,出現(xiàn)在肺部的叫肺癌。但現(xiàn)在人們發(fā)現(xiàn),在身體某一部位的某種癌癥的驅(qū)動(dòng)突變,有時(shí)候也可以出現(xiàn)在身體另一部位的癌癥中。

    根據(jù)部位和基因來(lái)定義癌癥,使治療方法不再受到傳統(tǒng)的限制。既往用于某種癌癥的藥物可能也對(duì)同一驅(qū)動(dòng)突變引起的另一種癌癥有效。比如,曲妥單抗和拉帕替尼本來(lái)用于HER2突變的乳腺癌患者。當(dāng)攜帶同一突變的晚期結(jié)腸癌患者服用這些藥物后,將近一半的病人存活期長(zhǎng)達(dá)一年左右,這是極其少見(jiàn)的。盡管類(lèi)似的關(guān)聯(lián)比較罕見(jiàn),但也意味著我們確實(shí)應(yīng)當(dāng)重新考慮癌癥的標(biāo)準(zhǔn)定義。

    2015年8月,NCI啟動(dòng)了一項(xiàng)名為MATCH的臨床試驗(yàn)。這項(xiàng)研究將招募840個(gè)志愿者,旨在為醫(yī)生提供更多信息,如何根據(jù)腫瘤的遺傳學(xué)信息選擇藥物治療方案。該研究將對(duì)5000個(gè)腫瘤樣本的DNA進(jìn)行測(cè)序,尋找可疑的突變,選擇相匹配的靶向藥物。試驗(yàn)開(kāi)始時(shí),共有10種基因-藥物組合,現(xiàn)在已增加到24種。符合條件的病人會(huì)使用其中的一種藥物治療。與此同時(shí),美國(guó)癌癥研究協(xié)會(huì)也投入2百萬(wàn)美元,開(kāi)始一項(xiàng)為期2年的項(xiàng)目GENIE。該項(xiàng)目將收集來(lái)自美國(guó)和歐洲7大癌癥中心數(shù)千名病人的腫瘤基因譜和臨床信息。該項(xiàng)研究數(shù)據(jù)有多重用途,包括發(fā)現(xiàn)更多適用于靶向治療的基因突變,尋找有助于腫瘤診斷和分期的生物標(biāo)志物等。

    這些努力預(yù)示著未來(lái)有望根據(jù)遺傳學(xué)特點(diǎn)為癌癥患者提供個(gè)性化治療。但目前仍有聲音質(zhì)疑這些努力需要多久以后才可能產(chǎn)生真正有價(jià)值的成果。此外,如果制藥公司將重心轉(zhuǎn)移到其他頗有前景的治療方法(如免疫療法)上,推動(dòng)癌癥靶向藥物研發(fā)的力量也會(huì)大大減弱。目前,精準(zhǔn)醫(yī)療的夢(mèng)想和現(xiàn)實(shí)之間仍存在著令人沮喪的鴻溝。

    END
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