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    “巔峰之作”:美國(guó)重磅推出“泛癌癥圖譜”,服務(wù)全人類

     圖書館三千零一 2018-04-07


    編譯 | 葉水送

    責(zé)編 | 李曉明


      


    4月5日,國(guó)際頂尖學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》及其子刊公布了“癌癥和腫瘤基因圖譜”(TCGA)的“升級(jí)版”——泛癌癥圖譜(PanCancer Atlas)的研究結(jié)果,相關(guān)結(jié)果以27篇高水平論文呈現(xiàn)。


    泛癌癥圖譜不僅側(cè)重于對(duì)腫瘤基因測(cè)序數(shù)據(jù)的分析,同時(shí)也對(duì)其他類型的數(shù)據(jù),如蛋白組、臨床以及影像方面的數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合分析。


    美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院主任弗朗西斯·科林斯(Francis Collins)表示,“該項(xiàng)目是過去進(jìn)行了10多年的TCGA項(xiàng)目的巔峰之作,能讓我們精準(zhǔn)找到腫瘤的發(fā)生原因,同時(shí)也為未來的臨床試驗(yàn)和治療帶來啟示。”


    ?《細(xì)胞》雜志以封面重點(diǎn)介紹了這一系列研究


    TCGA項(xiàng)目于2006年啟動(dòng),歷經(jīng)10多年,該項(xiàng)目對(duì)全球腫瘤研究產(chǎn)生了深遠(yuǎn)的影響。泛癌癥圖譜項(xiàng)目是TCGA項(xiàng)目的一部分,項(xiàng)目對(duì)來自11000個(gè)病例,33種不同癌癥類型進(jìn)行分析,從而能夠告訴我們?nèi)梭w的腫瘤發(fā)生、在哪里發(fā)生以及為什么發(fā)生。


    該項(xiàng)目由美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院資助,耗費(fèi)高達(dá)3億美元,由其下屬的兩個(gè)單位:國(guó)立人類基因組研究所(National Human Genome Research Institute)和國(guó)立癌癥研究所(National Cancer Institute)共同來執(zhí)行,大概有150名來自北美20余個(gè)高校院所的學(xué)者參與了該項(xiàng)目,其中也不乏華人學(xué)者的身影。


    TCGA數(shù)據(jù)主要是對(duì)腫瘤組織進(jìn)行的基因測(cè)序數(shù)據(jù),而泛癌癥圖譜項(xiàng)目則綜合了各種組學(xué)數(shù)據(jù),例如腫瘤的轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、甲基化組學(xué)、臨床以及影像方面的數(shù)據(jù)。


    《細(xì)胞》雜志副主編Robert Kruger對(duì)這一研究能發(fā)在《細(xì)胞》及其子刊上頗為榮幸,并表示,“泛癌癥圖譜如同人類癌癥研究的谷歌地球。” 


    該項(xiàng)目共分為三大部分:腫瘤細(xì)胞的來源、腫瘤發(fā)展的過程以及信號(hào)通路。通過對(duì)腫瘤細(xì)胞來源的研究,研究人員發(fā)現(xiàn),細(xì)胞的來源并不完全決定腫瘤的分類,由此我們需要重新審視腫瘤的分子分型。


     

    通過對(duì)腫瘤發(fā)生過程的全面認(rèn)識(shí),研究者發(fā)現(xiàn),生殖細(xì)胞的遺傳突變和體細(xì)胞突變,會(huì)通過對(duì)細(xì)胞信號(hào)通路、免疫細(xì)胞的影響,進(jìn)而對(duì)腫瘤發(fā)生進(jìn)程產(chǎn)生影響,由此給新的治療方式帶來啟示。

     


    該項(xiàng)目還對(duì)不同類型的腫瘤信號(hào)通路進(jìn)行研究,通過對(duì)MYC、RAS、泛素化、DNA的損傷修復(fù)機(jī)制等方面的研究,研究人員得出結(jié)論,信號(hào)通路在不同個(gè)體中差異大,由此需要針對(duì)不同的個(gè)體的個(gè)性化治療以及新的聯(lián)合用藥。


     “TCGA是率先對(duì)腫瘤組織進(jìn)行分子分型的第一個(gè)大型項(xiàng)目”,NHGRI負(fù)責(zé)TCGA項(xiàng)目的Carolyn Hutter表示,“10年前,進(jìn)行這個(gè)大型項(xiàng)目幾乎不可能,它有些過于雄心勃勃。”而“泛癌癥圖譜項(xiàng)目是對(duì)TCGA項(xiàng)目的有力補(bǔ)充,也是對(duì)該項(xiàng)目2013年發(fā)表的成果的擴(kuò)展,”NCI的TCGA項(xiàng)目主任Jean Claude Zenklusen表示。


    此次發(fā)表的27篇論文均可在《細(xì)胞》雜志及其子刊上開放獲取,有學(xué)者表示,“這是真正為人類服務(wù)”。該圖譜的出現(xiàn)不僅能極大地拓展我們對(duì)腫瘤這一類復(fù)雜疾病的認(rèn)識(shí),同時(shí)對(duì)腫瘤治療也會(huì)產(chǎn)生積極的影響。


    參考文章

    https://www./news-events/news-releases/nih-completes-depth-genomic-analysis-33-cancer-types

    https://linkinghub./retrieve/pii/S0092867418303817

    http://www./cell/fulltext/S0092-8674(18)30380-5

    制版編輯:常春藤 |

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