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本文首發于 ”百味科研芝士“ 微信公眾號 最近，小編在PUBMED上面發現一篇文章，就迫不及待的分享給小伙伴們~ 文章的題目也分享給小伙伴們~
下圖是這篇文章介紹TISIDB網站時候的配圖，話說TISIDB整合了五大數據庫的數據資源，對每個基因進行十種分析與注釋，夠逼格了吧！
下面，開始我們今天愉快的體驗~ 進入官網：http://cis./TISIDB/。主頁如下圖所示，該網站只需要我們在右下角搜索框內輸入研究基因，本帖以CD47為例，點擊提交。
跳轉界面后，點擊CD47基因名。
接下來就進入網站的分析界面了 第一個菜單是基因功能注釋，包括三個方面： > Subcellular Location, Domain and Function(亞細胞定位、結構域和功能) > Gene Ontology(GO) > KEGG and Reactome Pathway（KEGG）
頁面下拉即可查看~ 第二個菜單是文獻： 可以看到紅色方框里面的五大數據庫，下拉頁面是該網站引用的來自數據庫中的證據。
第三個菜單：CD47的高通量篩選數據集。
第四個菜單：免疫治療。
下拉頁面，第一個圖是各種數據集中免疫治療應答者和非應答者之間CD47的表達差異。
第二個圖是各種數據集中免疫治療應答者和非應答者之間CD47的突變差異。
第五個菜單：淋巴細胞
人類癌癥中CD47表達與免疫抑制劑之間的Spearman相關性。下拉箭頭所指，可以看拷貝變異數、甲基化、突變情況與免疫抑制劑之間的Spearman相關性。
其中X軸是腫瘤類型，Y軸是各種淋巴細胞。
下面我們以胰腺癌為例，X軸選胰腺癌，Y軸選Act_CD4，點擊Plot，則可看到胰腺癌中CD47與Act_CD4的相關性分析，如下圖右下所示。
第六個菜單：免疫調節劑。包括：免疫增強劑、免疫抑制劑、MHC分子
分別查看胰腺癌中免疫調節劑與CD47表達的相關性。
第七個菜單：趨化因子。包括趨化因子和受體
分別查看胰腺癌中趨化因子和受體與CD47表達的相關性。
第八個菜單：亞型。包括免疫亞型和分子亞型
第一幅圖中左圖是人類癌癥中免疫亞型中CD47表達的分布。右圖是在胰腺癌中不同免疫亞型中CD47的表達情況。
第二幅圖中左圖是人類癌癥中分子亞型中CD47表達的分布。右圖是在胰腺癌中不同分子亞型中CD47的表達情況。
第九個菜單：臨床。包括OS分析，腫瘤分期、分級
第一幅圖左側是CD47表達的各種腫瘤中的生存時間的分布，右側是是胰腺癌中CD47表達差異的OS生存曲線。
第二幅圖左圖是具有分期數據的各種腫瘤中CD47表達的分布。右圖是胰腺癌分期與CD47表達的相關性分析。
第三幅圖左圖是具有分級數據的各種腫瘤中CD47表達的分布。右圖是胰腺癌分級與CD47表達的相關性分析。
第十個菜單：藥靶 CD47基因在該網站上無用藥情況。我們不妨換個基因看看，比如MYC基因。
結果如下，可以看到以MYC為靶點的藥物是圖中以黑色方框來表示，綠色方框則是該藥物的其他靶點。
最后總結一下TISIDB網站的優勢，數據來源于五大數據庫，可進行十項分析，為用戶提供了一個友好的界面，可以瀏覽，搜索和下載數據。TISIDB宣稱數據來自2530種出版物的4176條記錄，這些出版物報告了988種與抗腫瘤免疫相關的基因。其次，它通過高通量篩選和基因組分析數據來鑒定與腫瘤細胞免疫細胞浸潤相關的基因。再者，其預先計算了30種TCGA癌癥類型的多個基因和免疫特征之間的關聯，例如淋巴細胞，免疫調節劑和趨化因子。 小伙伴們動動手點贊吧，這可是一個全新的網站哦！ |
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