來源:昆明動物所 2021-04-07 12:42 精神分裂癥(Schizophrenia,SCZ)是一種病因未明的重性精神疾病。SCZ的全球終身患病率約為1%,常發(fā)病于青壯年,且不到50%患者能獲得較好預后。SCZ的遺傳力高達80%,表明遺傳風險因素在SCZ中起主要作用。雖然在過去數(shù)十年中,精神分裂癥全基因組范圍內(nèi)的關聯(lián)研究(GWAS)鑒別到系列風險遺傳變異,但由于遺傳異質性和連鎖不平衡,如何從GWAS發(fā)現(xiàn)的基因座中進一步鑒別風險基因仍然存在挑戰(zhàn)。整合組學研究為風險基因鑒別提供了可行方法,通過整合大規(guī)模的GWAS研究和表達數(shù)量性狀基因座(eQTL)數(shù)據(jù),已經(jīng)報道了多個精神分裂癥風險基因。然而,目前用于整合分析的GWAS遺傳關聯(lián)數(shù)據(jù)和eQTL數(shù)據(jù)均主要來自歐洲人群。 近日,中國科學院昆明動物研究所研究員羅雄劍課題組利用整合組學研究方法(SMR和TWAS)對來自于亞洲人群的GWAS(22,778例病例和35,362例對照樣本)和eQTL(N=162)進行了整合分析,鑒定到東亞人群特異的精神分裂癥風險易感基因TMEM180。不同的整合分析均提示TMEM180的表達降低與精神分裂癥風險顯著相關(TWAS P =2.89×10-14,SMR P =6.04×10-5)。進一步的表達分析表明,TMEM180在SCZ患者中表達顯著下調(P =8.63×10-4)。此外,TMEM180在SCZ患者大腦中表達顯著降低(P =1.87×10-5)。利用神經(jīng)干細胞模型進行增殖、分化實驗以及轉錄組分析等探索TMEM180在精神分裂癥發(fā)病中的作用,結果表明TMEM180表達敲低造成神經(jīng)發(fā)育異常,并影響發(fā)育和突觸傳遞等SCZ相關通路。 該研究通過整合分析方法鑒別出東亞人群特異的精神分裂癥易感基因TMEM180,并結合神經(jīng)干細胞模型進一步闡明風險基因TMEM180在SCZ發(fā)生中的潛在致病機理。該研究也表明在中國人群中開展精神分裂癥遺傳研究和表達數(shù)量性狀基因座分析的重要性和必要性。(生物谷Bioon.com) |
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