寫在前面Emmm... 這段時間仍然在整理畢業論文的數據。這套數據,維度還是麻煩。表達量數據在做可視化時,總是覺得不夠直觀。為此,這三四天在外面忙事情的空閑時,我想到了一個不錯的實現。 常規熱圖展示的局限首先放出一張圖 可以看到,這張圖:
整體上,這樣繪制出來的熱圖確實是可以體現一些信息,但是非常不直觀,而且不能很好的顯示出樣品之間的區別與聯系。 LayoutHeatMap 的優勢首先還是放上一張圖, 在這個熱圖中,我們可以非常直觀地觀測,不同性別類型內部基因的表達變化,樣本間的關系,也可能很好的對比到不同組織相同時期的表達差異。換句話是,LayoutHeatMap讓你獲得更好的數據解讀體驗。 LayoutHeatMap 這個熱圖工具的名字是我起的,這樣繪制熱圖的方式可能是存在的,不過這類熱圖的繪制工具應是不存在的。 LayoutHeatMap 的使用LayoutHeatMap相比于普通的Heatmap,就是增加了Layout,用戶自己定義一個樣品布局即可。 其實,如果你樂意,你可以做成自己的Logo 寫在最后可視化是為了更好的解決數據,而不是為了炫技。只是有時候兩者會被結合在一起。 |
|