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平均熒光強度(Mean Fluorescence Intensity, MFI)描述偶聯抗體的信號強弱的一種方法。它常用的三種表示形式：幾何平均熒光強度（Geometric Mean Fluorescence Intensity）、中位數平均熒光強度（Median Mean Fluorescence Intensity）及算數平均熒光強度（Mean Fluorescence Intensity）。平均熒光強度在流式分析中是最易被誤解或誤用的工具。 三種熒光強度對應統計學中幾何指數，均值指數或中位數指數。因此，幾何平均熒光強度受異常值（無論值偏高或者偏低）的影響。算數平均熒光強度是熒光強度的平均值，它偏向于高平均熒光強度的一側。中位數平均熒光強度設定為50％; 其中50％的細胞高于或低于中點。中位數平均熒光強度受數據的傾斜、極端值等影響很小。一般來說，中位數平均熒光強度是最安全的MFI指標。下圖顯示了CD45-A405、CD69-PE兩種信號的熒光強度。對于hCD4 A405，使用幾何平均熒光強度、中值平均熒光強度和算數平均熒光強度的變化不大（都在1900左右），因為直方圖是一個緊密的峰值（峰值成正態分布）。相反，hCD69 PE具有更廣泛的分布，因此，幾何MFI（8917），中位數（12,784）和均值（16,809）的值差異大。幾何平均熒光強度最低，中位數平均熒光強度居中，算數平均熒光強度最高。通常，中值平均熒光強度可能是描述信號強度的最佳參數。
使用平均熒光強度常見的誤區 1.對于陰性峰與陽性峰具有明顯分群的樣本，使用百分比將產生更容易解釋和更具有統計學意義的數據（如圖）。
2.比較不同實驗的數據：由于熒光強度對實驗條件（如抗體稀釋、串聯染料降解、激光波動等）比較敏感，因此在多個實驗中比較任何類型的熒光強度都很危險 僅個人見解，如果不對請批評指正 |
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