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    復(fù)雜遺傳性狀大挑戰(zhàn),這些策略竟能輕松應(yīng)對(duì)!

     凌恩生物 2025-08-28 發(fā)布于陜西

    在農(nóng)業(yè)育種領(lǐng)域,水稻的食味品質(zhì)(Eating and Cooking Quality, ECQ)一直是一個(gè)備受關(guān)注的話題。隨著生活水平的提高,消費(fèi)者對(duì)高品質(zhì)水稻的需求日益增長(zhǎng),育種的重點(diǎn)也逐漸從提高產(chǎn)量轉(zhuǎn)向改善食味品質(zhì)。然而,食味品質(zhì)是一個(gè)由多個(gè)基因控制的復(fù)雜性狀,其遺傳調(diào)控機(jī)制至今尚未完全闡明。

    一項(xiàng)發(fā)表在《Plant Biotechnology Journal》上的“Genetic improvement of eating and cooking quality of rice cultivars in southern China”研究為我們揭開了南方水稻食味品質(zhì)遺傳改良的神秘面紗。這項(xiàng)研究通過對(duì)過去30年間在南方地區(qū)培育的290個(gè)水稻樣本(包括155個(gè)秈稻和135個(gè)粳稻)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)和選擇性馴化分析,揭示了食味品質(zhì)改良的遺傳基礎(chǔ)。

    中文標(biāo)題:南方水稻食煮品質(zhì)的遺傳改良

    期刊:Plant Biotechnology Journal

    影響因子:10.1

    一、技術(shù)路線

    技術(shù)路線圖

    二、研究結(jié)果

    1. 食味品質(zhì)的關(guān)鍵因素:直鏈淀粉和蛋白質(zhì)含量

    研究發(fā)現(xiàn),直鏈淀粉含量(AAC)和蛋白質(zhì)含量(PC)的降低是南方水稻食味品質(zhì)改良的關(guān)鍵因素。通過對(duì)這些品種的理化指標(biāo)(如AAC、PC、脂質(zhì)含量和食味值)進(jìn)行測(cè)定和相關(guān)分析,研究人員發(fā)現(xiàn)降低AAC和PC可以有效提升水稻的食味品質(zhì)。

    圖1 南方水稻品種AAC、PC、LC和TV的相關(guān)分析

    2. 優(yōu)良基因型的利用對(duì)提高水稻 ECQ 具有重要作用

    對(duì)290份水稻樣本重測(cè)序,進(jìn)行群體結(jié)構(gòu)分析和系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建,結(jié)果顯示品種分組與來源地密切相關(guān)。GWAS在秈稻中鑒定出14個(gè)與ECQ相關(guān)的顯著位點(diǎn),包含 WxOsbZIP76等已知功能基因;在粳稻中鑒定出17個(gè)顯著位點(diǎn),涉及OsBT1Wx等基因。通過選擇清除分析發(fā)現(xiàn),多數(shù)相關(guān)基因在人工選擇區(qū)域內(nèi)。進(jìn)一步分析表明,攜帶多個(gè)與AAC、PC 和TV相關(guān)的優(yōu)良基因等位基因組合,可有效提高ECQ。

    圖2 秈稻品種ECQ性狀相關(guān)基因的全基因組關(guān)聯(lián)研究

    圖3 粳稻品種ECQ性狀相關(guān)基因的全基因組關(guān)聯(lián)研究

    圖 基因選擇信號(hào)的鑒定(XP-CLR分析)

    3. 優(yōu)良等位基因組合提高 ECQ

    依據(jù)Wx等位基因變異對(duì)水稻品種分組分析,發(fā)現(xiàn)在相同Wx基因型背景下,適度降低PC可提高ECQ。在不同Wx等位基因背景下,不同基因組合對(duì)TV有顯著影響。例如,在秈稻Wxb亞組中,PC相關(guān)基因OsmtSSB1LOsDML4和TV相關(guān)基因RPBFDu3的優(yōu)良等位基因組合可進(jìn)一步降低PC、增加TV;在粳稻Wxb亞組中,OsBEIIbOsEro1Glup3FLO12OsNAC25等基因組成的模塊可降低AAC和PC、提高TV。

    圖4 優(yōu)良等位基因數(shù)量對(duì)AAC、PC和TV的影響分析

    圖5 等位基因組合與AAC、PC和TV的相關(guān)性分析

    4. 鑒定出優(yōu)良等位基因 RAmy1A 可改善 ECQ

    在攜帶Wxb等位基因的粳稻品種中,發(fā)現(xiàn)RAmy1A基因與ECQ相關(guān)。通過 GWAS定位、測(cè)序分析,確定該基因啟動(dòng)子區(qū)域SNP變異影響其表達(dá)。構(gòu)建突變體實(shí)驗(yàn)表明,RAmy1A可影響水稻ECQ,攜帶RAmy1A等位基因的品種具有更高的峰值粘度(PKV)和 TV。

    圖 RAmy1A調(diào)節(jié)淀粉粘度和口感值

    三、未來育種策略

    這項(xiàng)研究不僅揭示了南方水稻食味品質(zhì)改良的遺傳基礎(chǔ),還為未來的育種工作提供了新的思路和遺傳資源。通過綜合利用主效基因和微效基因,育種者可以更有效地提升水稻的食味品質(zhì),滿足消費(fèi)者對(duì)高品質(zhì)水稻的需求。

    參考文獻(xiàn)

    Genetic improvement of eating and cooking quality of rice cultivars in southern China. Plant Biotechnology Journal, 2024.

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