李時珍
明朝，湖北蘄州有一郎中李月池，醫術精湛，為人忠厚。他陪著兒子李時珍參加科舉考試，兒子對功名沒有興趣，只對醫學情有獨鐘。考試結束乘船歸來途中，李時珍鄭重地向父親要求學醫，為百姓解除病痛。李月池望著纖夫們吃力地拉著帆船行駛的情景，對兒子說：“你要真學醫，就得像這艘船一樣，一生都要逆流而上，而且還要永遠向前！”
李時珍出徒后，醫術高明，醫德高尚，深受尊重，有的病人甚至千里迢迢來找他看病。包鄉紳家里幾代人都開藥房，但他使用的是有許多錯誤的本草醫書，他又非常盲從，因此曾經造成多起耽誤病人治療甚至險些致人喪命的事故。李時珍對包鄉紳的盲從提出了批評，得罪了包鄉紳。包鄉紳的教訓讓李時珍擬重新修一部本草，以更好地服務患者。但父親告訴他：要修本草，必須由朝廷負責。李時珍決定請奏朝廷允許重修本草。
楚王的兒子得了專吃蠟燭燈芯的怪病，經李時珍治療很快痊愈。楚王大喜，當即封賞李時珍官職，但李時珍謝絕封賞，只求楚王能夠向朝廷啟奏重修草本，但被楚王拒絕。李時珍三番五次請奏，引起楚王反感，令他離開。李時珍要求去太醫院，楚王同意。李時珍進入太醫院后，繼續請求重修本草，遭到太醫們的嘲諷。李時珍據理力爭，但無人支持，最終被徹底否決。
在爭取朝廷支持無果后，李時珍決心自己動手重修本草。他把自己要修本草的帖子張貼在街上，很快得到老百姓的支持。有人為他提供藥方；有人獻出祖傳的醫書；他救治過的病人的兒子小溜（大名龐憲）長大成人后專程來拜他為師。李時珍和龐憲深入集市、民間搜集民間藥方，翻山越嶺風餐露宿采集草藥。被李時珍救過一命的郎中老魏在與李時珍意外相遇后，也追隨恩人參加本草的搜集。
一天，李時珍三人正在山上采集草藥，忽然一伙歹徒手持棍棒追來。三人逃跑時，老魏落入歹徒之手，歹徒將老魏扔下山崖喪命，并將草本札記也扔進瀑布。這一意外劫難，使李時珍師徒不得不重新再用幾年時間搜集丟失的草本。
歷經千辛萬苦，搜集草本工作終于完成。之后，李時珍在徒弟和家人的協助下，開始編纂《本草綱目》。李時珍從昔日的小伙子變成了白發蒼蒼的老人。李時珍和龐憲在街上意外地與一直支持李時珍父子的田二哥相遇。田二哥在南京開了一個書店，以刻板出書為業。得知李時珍正在編纂《本草綱目》，田二哥讓李時珍盡管寫書，刻板由他負責。幾年后，《本草綱目》編纂完成，但田二哥那邊卻一直沒有消息。李時珍判斷是二哥那里資金出了問題，于是決定自己出書，他變賣了自己的房產，籌集了資金，和龐憲來到南京尋找田二哥。找到田二哥的書店才知道：書店已被官府查封，二哥因刻制朝廷禁書被投入大牢。
再次遭受沉著打擊的李時珍，滿懷悲憤和無奈回到了家鄉。包鄉紳聞訊，主動前來要幫他刻板出書，但要他把批評方士、煉丹的內容刪除，李時珍堅持正確的論述，拒絕了包鄉紳。他下定決心，不管多難，一定要將《本草綱目》刻印出版，讓自己歷盡半生的心血之作惠及天下百姓。李時珍去世幾年后，《本草綱目》這部嘔心瀝血、歷時三十余載的藥物學著作終于出版。全書共52卷，記錄了1800多種藥物，其中新增加的藥物374種。書里對每一種藥物都說明了它的產地、形狀、顏色、氣味以及對癥疾病。書里還附有大量藥物形態圖，記載了1萬多個醫方。刊行后，很快被譯為多種外文，成為世界醫藥學的一部重要文獻。
田二哥（仲星火飾）反駁那些認為只有四書五經才是正道，物理、醫學等都是“雜學”的文人秀才們。
李月池（舒適飾）告訴兒子李時珍（趙丹飾）：真要學醫，就要一生要逆流而上，而且要永遠向前！
李時珍醫術高明，醫德高尚，有的病人千里迢迢來找他治病。
郎中老魏用了包鄉紳的藥險些致人死地，被病人家屬捆了起來，李時珍救了老魏，并給他盤纏、食物。
包鄉紳（韓濤飾）認為是老魏把病人給治壞了，與自己藥鋪抓的藥沒關系，要去找李時珍分辨清楚。
李時珍據理力爭，舊的草本書籍有不少錯誤之處，所以造成包鄉紳的藥鋪把藥抓錯了，險些釀成大禍。
對于藥物學書籍中的錯誤造成的后果，李時珍憂心忡忡，對父親說：想重修藥物草本書籍。
李時珍治好了楚王兒子的病，楚王封賞，他謝絕，只求楚王代奏朝廷準許重修草本藥典，但遭到拒絕。
李時珍來到太醫院，申請重修藥物草本典籍，遭到太醫們的圍攻、嘲諷和強烈反對。
李時珍尋求官府支持失敗后，準備自己重修草本典籍，老太醫聞訊把自己珍藏的醫學書籍送給李時珍。
百姓們也給李時珍送來了自己采集的或各種藥材和收藏的民間秘方。
李時珍和徒弟龐憲（康泰飾）踏遍青山，采集草藥。
郎中老魏（左，錢千里飾）也追隨救命恩人李時珍，到山上采集草藥樣本。
一伙歹徒追擊李時珍師徒三人，老魏被扔下山澗身亡，采藥札記也被扔到瀑布中大部分無從尋覓。
數年心血毀于一旦，師徒倆只好從頭再來。
李時珍與田二哥不期而遇，喜出望外。聊天才知道田二哥在南京開書店，以刻板印刷為業。
田二哥得知李時珍正在編纂《 本草綱目 》，讓他盡管寫，刻板、出書由他負責。
歷經數載，52卷本的《本草綱目》書稿終于完成，李時珍和家人及弟子們歡欣鼓舞。
田二哥因刻制朝廷禁書被捕入獄，書店也被查封。包鄉紳要有條件地幫助李時珍出書，被李時珍拒絕。
李時珍變賣了家產，要自己刻印《本草綱目》。雖然困難重重，但他相信總有一天書會出版。
李時珍逝世后，《本草綱目》歷盡風雨坎坷，終于問世，成為人類醫學史上的不朽的藥物典籍。
