1614年因“歸服益廣”將四旗改為正黃、正白、正紅、正藍，并增設鑲黃、鑲白、鑲紅、鑲藍四旗，合稱八旗，統率滿、蒙、漢族軍隊。正黃，鑲黃和正白旗列 為上三旗，上三旗 內無王，都歸皇帝所親統．兵是皇帝親兵，侍衛皇室的成員也從上三旗中選。正黃、鑲黃、正藍（后由多爾袞將正白旗代替正藍旗成為上三旗）三旗，由皇帝自將，稱為上三旗，余下五旗稱為下五旗。正藍旗在順治前與正黃，鑲黃列為上三旗，順治初，被多爾袞降入下五旗，不再由皇帝所親統而由諸王，貝勒和貝子分統。鑲黃、鑲白、鑲紅、鑲藍類似！
簡單地說，清八旗制度是清政府建立的一種軍事組織制度。
八旗的旗，滿語為gusa（固山），意為旗分（指一種軍制），并不是我們平時所認為的“旗幟”。一個旗分，分為漢軍，滿洲，蒙古三旗。
在旗分（固山）之下，有jalan（甲喇，意為參領）作為其低一級別的軍事機構，在甲喇之下又有niru（牛錄，意為佐領）作為其更低一級別的軍事機構。
所以我們可以把“旗”理解為現代部隊的“師級”。旗主，參領，佐領分別對應師長，旅長，營長，滿語為固山，甲喇，牛錄
其實清八旗的形成不是一蹴而就的，它有個循序漸進的過程，上面我所講述的內容只是最后成型的狀態，在漫長的演化過程中，清八旗制度也是從最開始的兩旗，到三旗，到四旗逐漸演變而來的。
二旗時期
最開始努爾哈赤時期，滿人只有二旗，分別為努爾哈赤統領的黃旗和舒爾哈齊（努爾哈赤弟弟）統領的黑旗，兩旗人數相當
而這里的黑旗就是日后八旗成型時藍旗的原型，至于后來為何改了顏色，并沒有統一的說法，一般認為是因為黑旗不利于在夜間辨識。
三旗時期
后來在1601年，努爾哈赤吞并了海西女真四部之一的哈達部，將哈達部編為白旗，由自己的大兒子褚英和哈達部首領（后來被廢）作為旗主共同管理。
此時便形成了黃旗，白旗，黑旗的三旗局面，史稱“三固山”時期。
四旗時期
1609年，藍旗旗主舒爾哈齊被努爾哈赤囚禁，藍旗勢力也被努爾哈赤一分為二，獨立分出紅旗，由自己的二兒子代善作為旗主管理。剩下的部分保持藍旗不變，由舒爾哈齊的二兒子阿敏管理。
1611年，努爾哈赤又囚禁了自己的大兒子褚英，任命第八子皇太極和長孫杜度共同管理白旗。
由此，四旗制度的格局正式成型。
八旗時期
1615年，在努爾哈赤的不斷征伐吞并之下，滿人軍隊人數得到了極大的擴充，于是下令將四旗分為八旗。
即黃旗分為正黃，鑲黃二旗，皆為自己統領，紅旗分為正紅，鑲紅二旗，分別由代善和他的兒子共同統領。
白旗分為正白，鑲白二旗，分別為皇太極和杜度統領。藍旗分為正藍，鑲藍二旗，分別由莽古爾泰（努爾哈赤第五子）和阿敏統領。
由此，清八旗制度正式建立成型。
努爾哈赤之后的皇太極，順治執政時期，八旗制度又經歷了多次旗主的替換變革，最終形成了皇帝親自統領正白，正黃，鑲黃三旗，各親王分別統領正紅，鑲紅，正藍，鑲藍，鑲白五旗的局面。
由此便誕生了我們耳熟能詳的“上三旗，下五旗”的說法。
一般上來說上三旗和下五旗的旗人待遇上并沒有什么差別，但是上三旗是由皇帝親自統領的，所以該旗的旗人只需對皇帝負責，而下五旗的旗人要對王公貴族和皇帝共同負責，在禮制上要略低一等。
所以毫無疑問，皇帝的出身肯定是出于上三旗的，有一些下五旗的王宮貴胄，親王嬪妃在取得很高的權勢之后，也可以進入上三旗，俗稱“抬旗”。
