一、霉菌的種類最為常見的霉菌：曲霉、青霉、鐮刀菌、麥角菌屬等。按生活習性分為：倉儲性霉菌（曲霉菌和青霉菌）和田間霉菌（青霉菌屬、麥角菌屬和鐮刀菌屬）。
1、曲霉屬
曲霉菌絲有隔膜，為多細胞霉菌。分生孢子梗頂端膨大成為頂囊，一般呈球形。曲霉屬中的大多數僅發現了無性階段，極少數可形成子囊孢子，故在真菌學中仍歸于半知菌類 。
2、黃曲霉
多見于發霉的糧食、糧制品及其它霉腐的有機物上。菌落生長較快，結構疏松，表面灰綠色，背面無色或略呈褐色。 黃曲霉毒素存在于土壤，動植物，各種堅果（如花生，核桃，大豆，稻谷，玉米，通心粉，調味品，牛奶，奶制品，食用油等制品）。一般在熱帶和亞熱帶地區,食品中黃曲霉毒素的檢出率比較高，在中國（廣西地區的產毒黃曲霉最多）產生黃曲霉毒素的產毒菌種主要為黃曲霉，黃曲霉毒素是黃曲霉和寄生曲霉的代謝產物。
3、米曲霉
米曲霉菌落生長快，質地疏松，初白色、黃色，后變為褐色至淡綠褐色。背面無色。分布甚廣，主要在糧食、發酵食品、腐敗有機物和土壤等處。是我國傳統釀造食品醬和醬油的生產菌種。也可生產淀粉酶、蛋白酶、果膠酶和曲酸等。會引起糧食等工農業產品霉變。 米曲霉是一類產復合酶的菌株，除產蛋白酶外，還可產淀粉酶、糖化酶、纖維素酶、植酸酶等。 米曲霉是理想的活性蛋白的載體,能生產大腸桿菌不能表達的真核生物。 米曲霉是常用的發酵菌種。
4、寄生曲霉
分生孢子梗單生，不分枝，末端擴展成具有1-2列小梗的頂囊，小梗上有成串的3.6-6μm球形分生孢子。分生孢子梗長300-700μm，延伸向頭狀物方向，擴寬到10-14μm。頂囊直徑16-25μm。培養物淺黃綠色。子囊階段不明顯。 寄生于多種同翅目，鱗翅目，膜翅目昆蟲。感染寄生曲霉的昆蟲，體表起初長有白色菌絲，后布滿黃綠色菌絲及其孢子。
5、黑曲霉
菌叢呈黑褐色，頂囊大球形，小梗雙層，分生孢子為球形，呈黑、黑褐色，平滑或粗糙。對紫外線以及臭氧的耐性強。菌絲發達，多分枝，有多核的多細胞真菌。 廣泛分布于土壤、空氣和谷物上，可引起食物、谷物和果蔬的霉腐變質。
6、煙曲霉
分生孢子穗圓筒形，呈深淺不同的綠色，分生孢子梗光滑，帶綠色；頂囊燒瓶狀，僅上半部產生孢子；分生孢子球形，有刺，綠色 。是一種重要的致病菌，也是引起食品腐敗的一種真菌。
7、青霉屬
青霉屬真菌的總稱。半知菌類，串珠霉目的一屬，例如那個橘子柚子腐爛了綠顏色的，毛霉，黑曲霉。間有性生殖階段。菌絲為多細胞分枝。無性繁殖時，菌絲發生直立的多細胞分生孢子梗。梗的頂端不膨大，但具有可繼續再分的指狀分枝，每枝頂端有2-3個瓶狀細胞，其上各生一串灰綠色分生孢子。分生孢子脫落后，再適宜的條件下萌發產生新個體。有性繁殖絕無僅有，如有發現，多歸于子囊菌綱曲霉科。常見于腐爛的水果、蔬菜、肉食及衣履上，多呈灰綠色。亦能引起柑橘的青霉病。有些種類如點青霉和黃青霉等可提取青霉素，灰黃青霉等可提取灰黃霉素。
8、鐮刀菌屬
鐮刀菌（Fusarium）是土壤中常見的腐生菌，是一種條件致病菌，可以引起侵襲性或局限性感染近年來由鐮刀菌引起惡性血液病、骨髓移植、實體器官移植、化療、嚴重的燒傷患者等免疫抑制患者的感染逐漸增多，播散性鐮刀菌病的預后差，對常用的抗真菌藥物敏感性較低。
無性期屬于有絲分裂孢子真菌亞門（半知菌）、絲孢綱、絲孢目、瘤座孢科。有性期屬于子囊菌亞門、核霉綱、肉座菌目、叢赤殼屬、麗赤叢殼屬、赤霉屬和隱殼霉屬，常見的鐮刀菌分為12組，30種。 二、霉菌的致病類型霉菌種類繁多，其中的一些種類是可以引起人類疾病的。由霉菌引起的人類疾病大致可以分為下面幾類：
1、感染癥：霉菌可以引起人類皮膚、皮下甚至全身的感染。最常見的皮膚性真菌感染癥是由皮膚癬菌引起的皮膚癬病。這是一種由接觸傳染的疾病，致病原只侵犯表淺的角質層。其中，俗稱香港腳的足癬和灰指甲的甲癬，都是一般民眾所熟悉的例子。全身性的霉菌病與霉菌孢子的吸入有關。霉菌孢子比花粉還小，可進入人的肺部和其它器官，引起全身癥狀。這一類感染的發生常具有地區性。
2、機緣性感染：引起機緣性感染的微生物通常不使人致病，有的為人體正常菌種的一部份。只有當局部或身體的免疫狀態異常，如免疫力下降或出現在異于原來居住部位時，這些微生物才會大量繁殖，成為致病菌。雖然一種引起鵝口瘡、慢性黏膜皮膚念珠菌病和女性陰道炎的單細胞真菌—白色念珠菌，被認為是最重要的機緣性感染性真菌，但某些霉菌，如曲霉菌中的Aspergillus fumigatus和白霉菌、酒曲霉菌也會引起機緣性感染。近年來，一些種類的霉菌如鐮包菌屬、瓶菌屬、Acremonium、毛癬菌屬中的某些菌也被發現在有免疫抑制劑使用者（如HIV感染者、器官移植者和癌癥患者）中成為新的機緣性真菌的趨勢。
3、過敏性疾病 某些種類的霉菌可引起人類的氣喘等過敏性疾病。這是由于霉菌孢子可達到比花粉更細的小氣道所引發的。在臺灣，由霉菌過敏原所引起的氣喘占全部氣喘患者的30％以上，病人主要以年齡較大者為主。室內空氣中最常見的青霉菌和曲霉菌的某些種類在其中扮演著重要角色。
4、由霉菌毒素引起的中毒癥 某些霉菌可產生毒性很強的毒素，按照它們的組織親和力可分為五種。如黃曲菌（Aspergillus flavus）產生的黃曲毒素（Aflatoxin）是一種肝臟毒素，由食入被毒素污染的谷物及花生而進入人體，可引起人類的肝癌。麥角毒素則是由Claviceps purpura產生的另一種毒素，由污染的谷粒進入人體，可作用血管及神經。
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