官宣|TCR測序&BCR測序

上一期我們聊了聊TCR測序的應用方向TCR測序，怎么哪哪都有你?

今天我們聊一聊TCR的官宣CPBCR

BCR是由兩條重鏈(H)和兩條輕鏈(κ或λ)組成的四聚體,其中重鏈分為可變區(V區)、恒定區(C區)、跨膜區及胞質區;輕鏈則只有V區和C區。V區由3個互補決定區(CDR1、CDR2和CDR3)組成,CDR的氨基酸/基因組成和排列順序呈現高度多樣性,在同一個體內,這種多樣性可達10⁹~10¹²,構成容量巨大的BCR庫。正是這種多樣性的存在,正常機體幾乎能夠對入侵的所有異物產生免疫應答。

B細胞抗原受體可轉導細胞增殖和凋亡兩種信號。細胞增殖信號最終可引起體液免疫應答，而凋亡信號最終可導致免疫耐受。它們的異常則可引起體液免疫應答缺陷或自身免疫。

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自身免疫/炎癥性疾病

1. 糖尿病-1型病人的BCR測序分析

Tissue distribution and clonal diversity of the T and B cell repertoire in type 1 diabetes.

Howard R. Seay, Erik Yusko,Stephanie J. Rothweiler, Lin Zhang, et al.

JCI Insight. 2016;1(20):e88242.

https://insight./articles/view/88242

2. 系統性紅斑狼瘡病人用藥后的BCR測序評估

Short-term assessment of BCR repertoires of SLE patients after high dose glucocorticoid therapy with high-throughput sequencing

Bin Shi, Jiang Yu, Long Ma, Qingqing Ma, Chunmei Liu,Suhong Sun, et al.Shi, B., Yu, J., Ma, L. et al.

SpringerPlus,2016; 5: 75.

https:///10.1186/s40064-016-1709-4

3. 多發性硬化癥患者的BCR測序分析

Intrathecal BCR transcriptome in multiple sclerosis versus other neuroinflammation: Equally diverse and compartmentalized, but more mutated, biased and overlapping with the proteome

Jorunn N.Johansen, FrodeVartdala, CindyDesmarais, Astrid E.V.Tutturen, etal.

Clinical Immunology.  2015;160(2):211-225

http://www./science/article/pii/S152166161500203X

4. Wiskott-Aldrich氏癥候群患者的BCR測序分析

Altered BCR and TLR signals promote enhanced positive selection of autoreactive transitional B cells in Wiskott-Aldrich syndrome

Nikita S. Kolhatkar, Archana Brahmandam, Christopher D. Thouvenel, etal.

Journal of Experimental Medicine. 2015;212(10):1663

http://jem./content/212/10/1663.full

傳染性疾病

1. 丙肝病毒（HCV）患者的BCR測序分析

Novel E2 Glycoprotein Tetramer Detects Hepatitis C Virus?Specific Memory B Cells

Maude Boisvert, Wanrui Zhang, Elizabeth J. Elrod, Nicole F. Bernard, etal.

Journal of Immunology. 2016;1600763

https:///10.4049/jimmunol.1600763

疾病診斷，血液學/腫瘤學

1. 肺癌患者腫瘤中BCR測序分析

A high density of tertiary lymphoid structure B cells in lung tumors is associated with increased CD4 T cell receptor repertoire clonality

Zhu W, Germain C, Liu Z1, Sebastian Y, Devi P, Knockaert S. etal.

OncoImmunology.  2015; 4(12)

https:///10.1080/2162402X.2015.1051922

2. 白血病/骨髓瘤MRD檢測

通過定量PCR (qPCR)檢測Ag受體基因重組的微小殘留病(MRD)監測一直是被認為是預測預后和對所有患者進行移植后治療的一種靈敏方法。

盡管該方法具有廣泛的臨床應用價值和標準化，但很多研究報道了干細胞移植后大量B淋巴細胞再生導致假陽性MRD結果的可能性。

下一代測序技術(NGS)能夠精確、靈敏地檢測多個Ag受體重排，從而提供比qPCR更準確的結果。

研究數據表明NGS在SCT后的所有管理中具有更好的特異性，表明旨在恢復即將復發的治療干預不應僅基于qPCR。

Next-generation sequencing indicates false-positive MRD results and better predicts prognosis after SCT in patients
with childhood ALL

M Kotrova, VHJ van der Velden, JJM van Dongen, R Formankova, P Sedlacek, M Brüggemann, J Zuna1, J Stary4, J Trka1 and E Fronkova1

Bone Marrow Transplantation (2017), 1-7

看了這些，你是否感受到BCR測序和TCR測序一樣應用廣泛，B細胞受體測序(BCR seq)，結合高通量測序技術，結合生物信息學分析手段，分析VDJ重排的方式等，廣泛應用于自身免疫性疾病、傳染性疾病、血液病和腫瘤的疾病診斷等。

TCR和BCR測序就全部講完了，有沒有覺得漲姿勢了呢？

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