文|陳根 人體腸道包含數(shù)百種不同種類的細菌群落,這些細菌對健康和疾病都發(fā)揮著重要的作用,它們被稱為腸道微生物群。此前已有研究表明,細菌種類與肥胖、免疫反應和心理健康等多種疾病有關。 然而,一個經(jīng)常被忽略的事實是,病毒在腸道微生物組中有著十分豐富的含量,并與人類的多種疾病休戚相關。近日,研究人員通過分析人類糞便,確認了5萬多種生活在人類腸道中的病毒,其中92%以前是未知的。 在新研究中,研究人員采用了一種被稱為宏基因組學的方法來獲得腸道微生物的基因圖。這種技術可以直接從環(huán)境中提取DNA,并對其進行隨機排序,以對腸道環(huán)境中存在什么生物以及它們可能在做什么有一個概況了解。 ![]() 利用該技術,研究人員從24個不同國家的11810個公開的糞便宏基因組中計算出病毒序列,最終得出了宏基因組腸道病毒目錄。該目錄包括189,680個病毒基因組,代表超過50,000個不同的病毒種類,是迄今為止同類研究中最大的數(shù)據(jù)序列。 這些病毒物種90%以上是未知的,它們總共能編碼超過45萬種不同的蛋白質(zhì)。其作用對微生物和人類宿主可能是有益的,也可能是有害的。值得注意的是,在這些病毒中,有超過75%是噬菌體。 噬菌體(phage)是侵襲細菌的病毒,也是賦予宿主菌生物學性狀的遺傳物質(zhì)。其必須在活菌內(nèi)寄生,有嚴格的宿主特異性。20世紀上半葉,噬菌體療法被視為對抗細菌感染的一種有前景的方法,但抗生素的興起導致了該研究的衰落,直到抗藥性細菌的出現(xiàn)又重新引起了人們對它的興趣。 ![]() 研究人員發(fā)現(xiàn)這些噬菌體的一個最常見功能是多樣性生成逆轉錄元件(DGR),這是一類能使特定目標基因發(fā)生突變,以產(chǎn)生有利于宿主的變異的遺傳因子。有趣的是,一些病毒顯示出驚人的地理差異。例如,crAssphage的一個亞種在亞洲很普遍,但在歐洲和北美的樣本中很少見或不存在。 未來,或可通過飲食干預、益生菌甚至“糞便菌群移植”來修改人們的腸道微生物群,以改善個人健康,噬菌體療法或許也可以進行補充。 |
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