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    Nature!“漸凍癥”開發預測模型,僅靠血液數據,AUC高達0.96

     妙趣橫生統計學 2025-08-26 發布于江蘇

    直播預告

    8.30-31日,“軌跡模型”新課開課,歡迎報名!
    軌跡模型在縱向數據分析中的深度應用

    肌萎縮側索硬化(ALS),又名漸凍癥,是一種慢性、進行性神經性疾病被世界衛生組織列為五大絕癥之一。

    臨床醫生長期以來一直在尋找一種可靠的 ALS 診斷方法。迄今為止,ALS 生物標志物的開發主要依賴于單一分析物的研究。

    今天和大家分享的這篇文章,選擇使用靜脈采血獲得的血漿蛋白識別可靠的ALS生物標志物,發現的一組由多個通路貢獻的 17 種蛋白證實了 ALS 的多重特性,并構建機器學習預測模型診斷ALS。

    這項研究于2025年8月19日,發表在Nature Medicine(醫學一區,IF=50.0
    我們重點看這篇文章中的機器學習構建預測模型的部分,在此之前,文章做了很多分析,感興趣的朋友可以去看看原文。

    在這項橫斷面研究中,研究者使用 Olink Explore 3072 平臺研究血漿蛋白組學作為該神經退行性疾病的生物標志物工具。與對照組相比,ALS 患者血漿中有 33 種蛋白的豐度存在差異。我們在一個獨立隊列中重復驗證了這些發現。
    而后,研究者對蛋白組學數據進行了監督式機器學習,以識別 ALS 的分子特征譜。為此,隨機選擇 80% 的樣本作為訓練集,其余樣本被指定為測試集。

    33 個差異豐度蛋白與臨床信息(包括取樣時年齡、性別及采血管類型;特征總數 = 36)被作為初始特征輸入模型。

    研究評估了 10 種監督式機器學習算法

    在測試集、外部驗證集 1 和外部驗證集 2 中,基于總體性能(AUC 與平衡準確率)選擇表現最佳的模型(隨機森林)。

    隨機森林模型在訓練集上進一步調優,并通過遺傳算法特征選擇方法對關鍵預測特征進行優先排序。

    經過二次特征選擇后,確定了 20 個最具預測性的特征(17 種蛋白、性別、取樣時年齡采血管類型,用于區分 ALS 病例與健康個體及其他神經系統疾病患者。

    在測試集中評估時,該模型的曲線下面積(AUC)為 0.962,平衡準確率為 89.3%。

    在外部驗證集 1中,該模型的 AUC 和平衡準確率分別為 99.8% 和 96.4%。

    外部驗證集 2中也取得了較高的 AUC 與平衡準確率,分別為 99.1% 和 88.1%。

    綜上所述,本研究表明血漿蛋白可作為該致命性疾病——漸凍癥的生物標志物,并為其前驅期提供了分子層面的見解。

    本研究可能的一種結果是,基于血漿的生物標志物可用作 ALS 的篩查工具,而腦脊液檢測可用于隨后確認。

    不過呢,話說回來,這種診斷模型有啥用呢?診斷了也沒法提前治療,只能引起更多的心理問題。

    參考文獻:Chia, R., Moaddel, R., Kwan, J.Y. et al. A plasma proteomics-based candidate biomarker panel predictive of amyotrophic lateral sclerosis. Nat Med (2025). https:///10.1038/s41591-025-03890-6


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